Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms