Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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