Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms