Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms