Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sh3bp1P55194 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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