Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfP51642 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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CntfP51642 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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CntfP51642 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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CntfP51642 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CntfP51642 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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