Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnpP16330 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnpP16330 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CnpP16330 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms