Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DmdP11531 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DmdP11531 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DmdP11531 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DmdP11531 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DmdP11531 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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DmdP11531 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DmdP11531 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms