Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms