Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms