Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rrn3B2RS91 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rrn3B2RS91 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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