Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim44Q9QXA7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim44Q9QXA7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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