Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms