Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2e1Q9D0D5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms