Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms