Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms