Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan1Q99J59 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms