Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms