Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd3Q8K2F0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms