Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms