Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lin52Q8CD94 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lin52Q8CD94 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lin52Q8CD94 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lin52Q8CD94 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lin52Q8CD94 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lin52Q8CD94 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin52Q8CD94 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms