Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atg16l1Q8C0J2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atg16l1Q8C0J2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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