Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop53Q8BK35 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nop53Q8BK35 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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