Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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