Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgap20Q6IFT4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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