Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim25Q61510 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms