Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctf1Q60753 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms