Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms