Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fchsd2Q3USJ8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms