Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpr55Q3UJF0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpr55Q3UJF0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpr55Q3UJF0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gpr55Q3UJF0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms