Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms