Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms