Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx2P81066 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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