Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba4aP68368 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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