Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms