Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VdrP48281 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VdrP48281 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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