Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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