Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcna1P16388 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms