Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nek2O35942 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nek2O35942 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nek2O35942 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nek2O35942 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms