Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms