Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms