Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod3E9QA62 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms