Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ryr1E9PZQ0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms