Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms