Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mid2Q9QUS6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mid2Q9QUS6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms