Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms