Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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