Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thumpd2Q9CZB3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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