Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms