Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfdQ925I7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfdQ925I7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms